La misión de la Institución declarada Sitio de Interés Cultural por la Legislatura porteña es la de mantener viva la conciencia de la existencia del asesinato planificado de seis millones de judíos a manos de los nazis, durante la Segunda Guerra Mundial; alertar acerca de los peligros del genocidio y la discriminación; y luchar a favor de la convivencia en la diversidad cultural.

Esta misión se cumple a través de un amplio programa educativo que incluye visitas guiadas, cursos y capacitaciones abiertos a toda la sociedad; seminarios, congresos, biblioteca, videoteca y préstamo de materiales a educadores.

La muestra permanente del Museo desarrolla a través de textos e imágenes los sucesos antes, durante y después del Holocausto y refleja la vivencia del nazismo en nuestro país. Asimismo, cuenta con muestras itinerantes propias y de Museos de Estados Unidos e Israel.

A través de la Editorial Nuestra Memoria, el Museo del Holocausto de Buenos Aires produce materiales educativos para docentes y alumnos secundarios y universitarios, como son “El Holocausto en 10 láminas” y la revista académica Nuestra Memoria, editada de manera ininterrumpida desde 1994.